Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms