Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms