Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNDC8Q6A555 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNDC8Q6A555 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNDC8Q6A555 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNDC8Q6A555 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNDC8Q6A555 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNDC8Q6A555 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC8Q6A555 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TXNDC8Q6A555 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms