Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HES3Q5TGS1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms