Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3BQ5T9A4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3BQ5T9A4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms