Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms