Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms