Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms