Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP78Q5JTW2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP78Q5JTW2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP78Q5JTW2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms