Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms