Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms