Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRY2Q49AN0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRY2Q49AN0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRY2Q49AN0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRY2Q49AN0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CRY2Q49AN0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRY2Q49AN0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRY2Q49AN0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms