Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms