Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms