Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF212Q495C1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms