Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms