Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC142Q17RM4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
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