Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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