Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCEA2Q15560 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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