Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDSNQ15517 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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