Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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