Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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