Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
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