Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PDE3BQ13370 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
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