Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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ERCC8Q13216 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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ERCC8Q13216 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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ERCC8Q13216 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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ERCC8Q13216 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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ERCC8Q13216 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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ERCC8Q13216 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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ERCC8Q13216 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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ERCC8Q13216 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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