Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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