Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWF1Q12792 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms