Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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GTF3C1Q12789 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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GTF3C1Q12789 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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GTF3C1Q12789 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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GTF3C1Q12789 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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GTF3C1Q12789 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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GTF3C1Q12789 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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