Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD300CQ08708 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms