Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms