Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRTAP1-1Q07627 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KRTAP1-1Q07627 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRTAP1-1Q07627 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KRTAP1-1Q07627 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRTAP1-1Q07627 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRTAP1-1Q07627 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRTAP1-1Q07627 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KRTAP1-1Q07627 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRTAP1-1Q07627 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRTAP1-1Q07627 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRTAP1-1Q07627 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRTAP1-1Q07627 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRTAP1-1Q07627 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRTAP1-1Q07627 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-1Q07627 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms