Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms