Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOP2BQ02880 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms