Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLCB3Q01970 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms