Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms