Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VLDLRP98155 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VLDLRP98155 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VLDLRP98155 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms