Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX1P83916 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX1P83916 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX1P83916 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX1P83916 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX1P83916 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX1P83916 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX1P83916 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX1P83916 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX1P83916 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX1P83916 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX1P83916 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX1P83916 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX1P83916 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX1P83916 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX1P83916 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX1P83916 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX1P83916 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX1P83916 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX1P83916 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX1P83916 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX1P83916 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX1P83916 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX1P83916 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX1P83916 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX1P83916 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX1P83916 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX1P83916 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX1P83916 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX1P83916 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX1P83916 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX1P83916 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX1P83916 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX1P83916 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX1P83916 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX1P83916 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBX1P83916 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBX1P83916 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBX1P83916 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBX1P83916 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBX1P83916 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX1P83916 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX1P83916 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX1P83916 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX1P83916 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX1P83916 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX1P83916 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX1P83916 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX1P83916 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX1P83916 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX1P83916 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX1P83916 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX1P83916 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX1P83916 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX1P83916 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX1P83916 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX1P83916 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX1P83916 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX1P83916 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX1P83916 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX1P83916 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX1P83916 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX1P83916 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX1P83916 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX1P83916 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX1P83916 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX1P83916 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX1P83916 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX1P83916 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX1P83916 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX1P83916 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX1P83916 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX1P83916 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX1P83916 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX1P83916 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX1P83916 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX1P83916 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX1P83916 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX1P83916 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX1P83916 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX1P83916 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX1P83916 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX1P83916 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX1P83916 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX1P83916 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX1P83916 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX1P83916 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX1P83916 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX1P83916 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX1P83916 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX1P83916 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX1P83916 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX1P83916 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX1P83916 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms