Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms