Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPFP62306 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms