Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UFM1P61960 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UFM1P61960 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UFM1P61960 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UFM1P61960 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UFM1P61960 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UFM1P61960 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFM1P61960 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFM1P61960 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFM1P61960 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFM1P61960 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFM1P61960 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFM1P61960 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFM1P61960 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
UFM1P61960 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFM1P61960 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFM1P61960 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFM1P61960 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFM1P61960 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFM1P61960 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFM1P61960 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFM1P61960 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFM1P61960 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFM1P61960 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFM1P61960 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFM1P61960 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFM1P61960 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFM1P61960 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFM1P61960 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFM1P61960 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFM1P61960 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFM1P61960 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFM1P61960 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFM1P61960 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFM1P61960 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFM1P61960 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFM1P61960 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFM1P61960 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFM1P61960 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFM1P61960 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFM1P61960 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UFM1P61960 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFM1P61960 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFM1P61960 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UFM1P61960 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFM1P61960 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFM1P61960 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFM1P61960 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UFM1P61960 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFM1P61960 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFM1P61960 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFM1P61960 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFM1P61960 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFM1P61960 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFM1P61960 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFM1P61960 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFM1P61960 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFM1P61960 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFM1P61960 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFM1P61960 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFM1P61960 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFM1P61960 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFM1P61960 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFM1P61960 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFM1P61960 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFM1P61960 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFM1P61960 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFM1P61960 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFM1P61960 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UFM1P61960 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFM1P61960 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFM1P61960 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFM1P61960 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFM1P61960 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFM1P61960 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFM1P61960 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFM1P61960 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms