Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERV-K104P61576 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERV-K104P61576 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms