Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVK-21P61565 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms