Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1AP61163 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1AP61163 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms