Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB2AP61019 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms