Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms