Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP6P59044 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP6P59044 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms