Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms