Protein–RNA interactions for Protein: P57087

JAM2, Junctional adhesion molecule B, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM2P57087 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM2P57087 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM2P57087 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM2P57087 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM2P57087 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM2P57087 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM2P57087 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
JAM2P57087 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
JAM2P57087 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
JAM2P57087 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
JAM2P57087 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
JAM2P57087 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
JAM2P57087 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
JAM2P57087 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
JAM2P57087 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
JAM2P57087 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAM2P57087 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAM2P57087 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAM2P57087 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAM2P57087 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAM2P57087 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAM2P57087 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAM2P57087 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAM2P57087 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAM2P57087 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAM2P57087 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAM2P57087 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
JAM2P57087 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
JAM2P57087 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
JAM2P57087 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
JAM2P57087 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23■■□□□ 1.27
JAM2P57087 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
JAM2P57087 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
JAM2P57087 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
JAM2P57087 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
JAM2P57087 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23■■□□□ 1.27
JAM2P57087 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
JAM2P57087 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23■■□□□ 1.27
JAM2P57087 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM2P57087 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM2P57087 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM2P57087 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM2P57087 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM2P57087 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM2P57087 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM2P57087 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM2P57087 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM2P57087 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM2P57087 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM2P57087 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM2P57087 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM2P57087 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM2P57087 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM2P57087 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM2P57087 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
JAM2P57087 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
JAM2P57087 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
JAM2P57087 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
JAM2P57087 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
JAM2P57087 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
JAM2P57087 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
JAM2P57087 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
JAM2P57087 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
JAM2P57087 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
JAM2P57087 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
JAM2P57087 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
JAM2P57087 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
JAM2P57087 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
JAM2P57087 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JAM2P57087 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
JAM2P57087 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
JAM2P57087 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JAM2P57087 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JAM2P57087 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
JAM2P57087 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JAM2P57087 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
JAM2P57087 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JAM2P57087 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
JAM2P57087 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JAM2P57087 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
JAM2P57087 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms