Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRG3P56975 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRG3P56975 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRG3P56975 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRG3P56975 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRG3P56975 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRG3P56975 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRG3P56975 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRG3P56975 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRG3P56975 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRG3P56975 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRG3P56975 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRG3P56975 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
NRG3P56975 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRG3P56975 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRG3P56975 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRG3P56975 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRG3P56975 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRG3P56975 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRG3P56975 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRG3P56975 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms