Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms